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These routine analyses, realized on a tariff base, concern the identification of major proteins contained in bands or "spots" of 1D or 2D gels colored in the blue of coomassie or in the silver nitrate. The 1D or 2D gels are realized by the customer (tint and included cut) or, on demand by the platform.
Analyses are realized on the platform by the classic methods (mass cards MALDI-MS and/or sequencing LC-MS/MS) according to the request of the customer. The biocomputing researches for the identifications are realized in the banks of protein sequences. |
| Etapes d’une demande d’analyse de routine : |
| 2 - Le client envoie la demande par mail ou par courrier à la plateforme |
| 3 - Dès réception, le conseil scientifique de la plate-forme examine la demande. Si nécessaire, un contact est pris avec le demandeur pour lui apporter des conseils et le guider dans ses choix (préparation d’échantillon, choix de technologie, …). |
| 4 - La plate-forme informe par mail le client que : |
| • L’analyse peut être réalisée comme demandée (le client envoie l’échantillon et joint la demande d’analyse protéomique accompagnée du bon de commande). |
| • La demande correspond à des analyses complexes et il convient de discuter de la mise en place d’un projet de recherche. |
| • La plate-forme ne peut répondre à la demande; le client est alors conseillé et orienté vers une autre plate-forme ou un autre laboratoire. |
| • le pré-traitement robotisé (réduction/alkylation), |
| • l’analyse par MALDI-MS ou LC-MS/MS, |
| • la recherche dans les banques de séquences protéiques publiques, |
| • le rendu des résultats sous forme d’un tableau dans un rapport |
| L’analyse est réalisée dans la mesure du possible sous 2 semaines ouvrées. |
| Pour les utilisateurs sans expérience dans le domaine de la préparation d’échantillons, des fiches conseil sont mises à disposition : |
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