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Ces analyses de routine, réalisées sur une base tarifaire, portent sur l’identification des protéines majeures contenues dans des bandes ou «spots» de gels 1D ou 2D colorés au bleu de coomassie ou au nitrate d’argent. Les gels 1D ou 2D sont réalisés par le client (coloration et découpe comprise). Les analyses sont réalisées sur la plate-forme par les méthodes classiques (cartes massiques MALDI-MS et/ou séquençage LC-MS/MS) en fonction de la demande du client. Les recherches bioinformatiques pour les identifications sont réalisées dans les banques de séquences protéiques. Les tarifs sont indiqués pour chaque type de prestation. |
Etapes d’une demande d’analyse de routine : |
2 - Le client envoie la demande par mail ou par courrier à la plateforme |
3 - Dès réception, le conseil scientifique de la plate-forme examine la demande. Si nécessaire, un contact est pris avec le demandeur pour lui apporter des conseils et le guider dans ses choix (préparation d’échantillon, choix de technologie, …). |
4 - La plate-forme informe par mail le client que : |
• L’analyse peut être réalisée comme demandée (le client envoie l’échantillon et joint la demande d’analyse protéomique accompagnée du bon de commande). |
• La demande correspond à des analyses complexes et il convient de discuter de la mise en place d’un projet de recherche. |
• La plate-forme ne peut répondre à la demande; le client est alors conseillé et orienté vers une autre plate-forme ou un autre laboratoire. |
• le pré-traitement robotisé (réduction/alkylation), |
• l’analyse par MALDI-MS ou LC-MS/MS, |
• la recherche dans les banques de séquences protéiques publiques, |
• le rendu des résultats sous forme d’un tableau dans un rapport |
L’analyse est réalisée dans la mesure du possible sous 2 semaines ouvrées. |
Pour les utilisateurs sans expérience dans le domaine de la préparation d’échantillons, des fiches conseil sont mises à disposition : |
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